下關(guān)火車站初稱為滬寧鐵路南京車站，國民政府定都南京后，改稱南京下關(guān)車站；汪偽時(shí)期，一度稱為南京車站；1968年底，位于玄武湖北側(cè)的南京火車站建成后，更名為南京西站。

下關(guān)火車站初建于清光緒三十一年（1905年）。按當(dāng)時(shí)統(tǒng)一規(guī)格“一等站屋”設(shè)計(jì)，有大小平房18間，建筑面積520平方米。有大廳、票房、電報(bào)房、站長房、郵政房、貨物經(jīng)理人房等建筑設(shè)施。候車室僅有兩小間，木結(jié)構(gòu)屋頂，屋面鋪蓋瓦楞白鐵皮。共有站臺(tái)三道，分別長216米、229米和203米。1930年，國民政府鐵道部對(duì)車站進(jìn)行重建。重建的車站為中間3層、兩側(cè)2層的建筑，中部為橢圓形車站大廳，車站站臺(tái)上蓋有雨篷。1947年，國民政府對(duì)下關(guān)火車站進(jìn)行擴(kuò)建。擴(kuò)建工程由基泰工程司楊廷寶建筑師設(shè)計(jì)，徐順興營造廠建造，當(dāng)年完工。擴(kuò)建后的車站，增建了一座呈“U”字形圍住原車站的大樓，南北兩翼為2層，正面為高架拱形大廳，門高15米。建筑全部采用鋼筋混凝土結(jié)構(gòu)，面積1.87萬平方米，可容納4000余名旅客候車。大廳南側(cè)設(shè)置行包房、售票處，還有檢票口及輔助出入口各1個(gè)；北側(cè)為貴賓室、郵件用房以及出入口。由于擴(kuò)建施工逐段進(jìn)行，原有站房設(shè)備得到保留和利用，故對(duì)車站正常運(yùn)營無甚影響，并且節(jié)約了工程投資。1948年，又增建站臺(tái)1座。1949年，國民黨軍隊(duì)潰敗時(shí)，車站中央大廳遭到毀壞。新中國建立后，南京市人民政府重新修復(fù)，建成1800平方米的候車廳。2006年6月被列為市級(jí)文物保護(hù)單位。

1912年元月1日，孫中山由上海到南京就任中華民國臨時(shí)大總統(tǒng)，便是經(jīng)過下關(guān)火車站進(jìn)人南京城的。1946年6月23日，上海市各界群眾10余萬人舉行反內(nèi)戰(zhàn)、要和平的群眾大會(huì)，推選出以馬敘倫、胡厥文、閻寶航、雷潔瓊等9人為代表的上海人民和平--團(tuán)，前來南京向國民政府--。當(dāng)--團(tuán)于當(dāng)晚到達(dá)下關(guān)火車站時(shí)，擔(dān)任津浦鐵路調(diào)查統(tǒng)計(jì)室主任的中統(tǒng)特務(wù)頭子陳叔平，糾集一批暴徒，偽裝成蘇北難民，對(duì)--代表大打出手，毆傷包括代表團(tuán)團(tuán)長馬敘倫在內(nèi)的代表團(tuán)成員多人。前往歡迎代表團(tuán)的民盟代表葉篤義、現(xiàn)場(chǎng)采訪的《大公報(bào)》記者高集、《新民報(bào)》記者浦熙修也遭毒打，釀成了震驚世界的“下關(guān)慘案”。暴徒們行兇鬧事5個(gè)多小時(shí)后，軍警方才到車站維持秩序，用卡車將代表押往南京警備司令部。在代表強(qiáng)烈-及多方努力下，直到深夜，受傷代表才被送往中央醫(yī)院救治。正在南京與國民黨談判的中共代表團(tuán)周恩來、董必武、鄧穎超聞?dòng)嵑?，即前往醫(yī)院慰問，并向當(dāng)局提出強(qiáng)烈-。